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57 Treffer

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    Contrasting new and available reference genomes to highlight uncertainties in assemblies and areas for future improvement: an example with monodontid species.
    Bringloe, Trevor T. ; Parent, Geneviève J.
    In: BMC Genomics, Jg. 24 (2023-11-20), Heft 1, S. 1-16
    Online academicJournal
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    A scaffolded and annotated reference genome of giant kelp (Macrocystis pyrifera).
    Diesel, Jose ; Molano, Gary ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 24 (2023-09-13), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    Characterization of a strain-specific CD-1 reference genome reveals potential inter- and intra-strain functional variability.
    Jung, Yoon Hee ; Wang, Hsiao-Lin V. ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 24 (2023-08-04), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    A high-continuity and annotated tomato reference genome.
    Su, Xiao ; Wang, Baoan ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 22 (2021-12-15), Heft 1, S. 1-12
    Online academicJournal
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    Re-examination of two diatom reference genomes using long-read sequencing.
    Filloramo, Gina V. ; Curtis, Bruce A. ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 22 (2021-05-24), Heft 1, S. 1-25
    Online academicJournal
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    Using multiple reference genomes to identify and resolve annotation inconsistencies.
    Monnahan, Patrick J. ; Michno, Jean-Michel ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 21 (2020-04-08), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    Usability of reference-free transcriptome assemblies for detection of differential expression: a case study on Aethionema arabicum dimorphic seeds.
    Wilhelmsson, Per K. I. ; Chandler, Jake O. ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 20 (2019-01-30), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    Regional genetic differences among Japanese populations and performance of genotype imputation using whole-genome reference panel of the Tohoku Medical Megabank Project.
    Yasuda, Jun ; Katsuoka, Fumiki ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 19 (2018-07-24), Heft 1, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Strategies for optimizing BioNano and Dovetail explored through a second reference quality assembly for the legume model, Medicago truncatula.
    Moll, Karen M. ; Zhou, Peng ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 18 (2017-08-04), S. 1-16
    Online academicJournal
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    Positional bias in variant calls against draft reference assemblies.
    Briskine, Roman V. ; Shimizu, Kentaro K.
    In: BMC Genomics, Jg. 18 (2017-03-28), S. 1-13
    Online academicJournal
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    Improvement of the banana “Musa acuminata” reference sequence using NGS data and semi-automated bioinformatics methods
    Martin, G. ; Baurens, F.C. ; et al.
    In: BMC Genomics, 2016
    Online academicJournal
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    View record in BASE (Volltext) Volltext
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    A robust (re-)annotation approach to generate unbiased mapping references for RNA-seq-based analyses of differential expression across closely related species.
    Torres-Oliva, Montserrat ; Almudi, Isabel ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 17 (2016-05-24), S. 1-19
    Online academicJournal
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    An improved genome reference for the African cichlid, Metriaclima zebra.
    Conte, Matthew A. ; Kocher, Thomas D.
    In: BMC Genomics, Jg. 16 (2015-09-23), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    Divergences in gene repertoire among the reference Prevotella genomes derived from distinct body sites of human.
    Gupta, Vinod Kumar ; Chaudhari, Narendrakumar M. ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 16 (2015-03-01), Heft 1, S. 1-16
    Online academicJournal
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    SHEAR: sample heterogeneity estimation and assembly by reference.
    Landman, Sean R. ; Tae Hyun Hwang ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 15 (2014-02-01), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Sources of bias in measures of allele-specific expression derived from RNA-seq data aligned to a single reference genome.
    Stevenson, Kraig R. ; Coolon, Joseph D. ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 14 (2013-09-01), Heft 1, S. 1-13
    Online academicJournal
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    A reference genetic map of C. clementina hort. ex Tan.; citrus evolution inferences from comparative mapping.
    Ollitrault, Patrick ; Terol, Javier ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 13 (2012), Heft 1, S. 593-612
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    Quantitative RNA-Seq analysis in non-model species: assessing transcriptome assemblies as a scaffold and the utility of evolutionary divergent genomic reference species.
    Hornett, Emily A. ; Wheat, Christopher W.
    In: BMC Genomics, Jg. 13 (2012), Heft 1, S. 361-376
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    Improving ancient DNA read mapping against modern reference genomes.
    Schubert, Mikkel ; Ginolhac, Aurelien ; et al.
    In: BMC Genomics, Jg. 13 (2012), Heft 1, S. 178-192
    Online academicJournal
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    Generation of a reference transcriptome for evaluating rainbow trout responses to various stressors.
    In: BMC Genomics, Jg. 12 (2011-01-03), Heft Suppl 2, S. 626-640
    Online academicJournal
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